Le travail de Johanne Saint-Charles concerne les liens entre la santé, l'environnement et la société avec une attention particulière pour le genre et les inégalités sociales. Elle fait partie des membres fondatrices de communautés de pratique en écosanté en Amérique latine et au Canada, et elle a contribué à la chaire de recherche Ecosanté sur la pollution urbaine en Afrique de l'Ouest. Elle a toujours considéré qu'il était important de soutenir les chercheuses et chercheurs émergents par le mentorat et des possibilités de travailler sur des projets collaboratifs. Elle a mis sa formation disciplinaire en communication et en réseaux au service d'équipes transdisciplinaires qui étudient les déterminants de la santé tout en cherchant à concevoir des réponses durables aux problèmes de santé et aux disparités. Elle est actuellement directrice de l'Institut Santé et société.